Řeší se to už docela dlouho a existuje velká hromada míst, kde co a jak upravit, aby se toto nedělo. A stejně se děje.
Nakonec jsem našel problém v souboru /usr/share/applications/defaults.list
Stačí odmazat řádek
x-scheme-handler/ftp=firefox.desktop;google-chrome.desktop